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店舗ごとにバージョンを変えるって要件が、何故おきるかって言う話ですが、要件を決定する人が、それがどのような影響を受けるか認識していない。かつ、勝手にお客さんに約束してきてしまうというのが原因ですね。また、こんな要件は、開発が進んで後になってから勝手に追加されたりするので始末が悪い。全員に影響出るし、テーブルレイアウトが違えば、DBも2面もったりしなければならないですね。
僕自身、受けるべきではない要件とも思いますね。何らかの業務の特殊性から必要だった場合も、最初に言っておいてほしい(検討に時間を掛けたい)項目だと思います。